728x90 반응형 Company12 Structural and Physicochemical Features of Oral PROTACs Journal of Medicinal ChemistryVol 67/Issue 15 Article July 30, 2024 제목 : Structural and Physicochemical Features of Oral PROTACs Approach 방법:PROTACs의 개념과 필요성 설명PROTACs는 Proteolysis Targeting Chimeras로, 세포 내 표적 단백질을 분해하기 위해 설계된 화합물입니다. PROTAC는 E3 리가제와 표적 단백질에 결합하여 이들을 근접하게 만들어 유비퀴틴-프로테아좀 시스템을 통해 표적 단백질을 분해합니다. PROTACs는 약 550~1600 Da의 큰 분자 크기를 가지며, 경구 흡수를 달성하는 것이 도전 과제입니다.경구 투여 가능성을 높이는 PROTAC 설계의.. 2024. 9. 4. Interplay of PROTAC Complex Dynamics for Undruggable Targets: Insights into Ternary Complex Behavior and Linker Design 이 논문의 연구내용은 PROTAC(Proteolysis-Targeting Chimera)라는 단백질 분해 기술을 활용하여 기존의 약물로는 타겟팅하기 어려운 단백질을 선택적으로 제거하는 방법에 대한 내용을 다룹니다. PROTAC은 목표 단백질과 E3 리가아제를 연결하여 단백질을 유비퀴틴-프로테아좀 시스템으로 유도하고 분해합니다. 연구의 주요 초점은 삼원 복합체의 형성과 분해를 이해하는 데 있으며, 특히 E3 리가아제와 목표 단백질 간의 상호작용, 결합 역학, 선택성, 링크 길이, 그리고 PROTAC의 구조적 변화에 중점을 둡니다.주요 내용 요약:PROTAC의 혁신성과 장점: PROTAC은 기존의 소분자 억제제와 다르게 타겟팅 유연성, 높은 효능, 선택성, 지속적인 분해 효과 등의 이점을 가지고 있습니다. .. 2024. 8. 27. 🔍 다중 회귀 분석으로 용해도 예측하기: 신약 개발에서의 효율적인 합성 우선순위 결정법 💊 신약 연구 과정에서 매디캠의 합성 업무를 효율화하기 위해 예측 프로그램을 만들었습니다. 이 프로그램의 Prediction 데이터와 실제 Experimental value 데이터 간의 상관성을 분석하여, 합성 우선순위를 결정하고자 합니다. 이를 통해 실험적으로 합성할 화합물의 수를 줄이고 업무의 효율성을 높이려는 목표입니다. Prediction 데이터와 Experimental value 데이터 간의 상관성을 분석하기 위해, 다음과 같은 절차를 진행할 수 있습니다:데이터 전처리: Prediction과 Experimental value 시트에서 필요한 데이터를 추출하고, 동일한 화합물에 대한 데이터가 매칭되는지 확인합니다.상관 분석: 두 데이터 간의 상관성을 분석하기 위해 피어슨 상관계수 또는 스피어만 상관계.. 2024. 8. 14. CW-3308의 개발: 선택적이고 경구투여 가능한 BRD9 PROTAC 분해제 논문 "CW-3308의 개발: 선택적이고 경구투여 가능한 BRD9 PROTAC 분해제"는 CW-3308이라는 화합물을 개발하여 BRD9 단백질을 표적으로 하는 치료제 개발에 관한 연구입니다. 이 연구는 BRD9이 다양한 암에서 중요한 역할을 하며, 이를 효과적으로 표적화할 수 있는 PROTAC 기술을 활용한 분해제를 개발하는 것을 목표로 하고 있습니다. 아래는 연구 내용을 자세히 정리한 것입니다. 1. 실험 목적이 연구의 주요 목적은 BRD9 단백질을 표적으로 하여 강력하고 선택적이며 경구 투여가 가능한 PROTAC 분해제를 개발하는 것입니다. BRD9은 활막육종, 악성라브도이드 종양과 같은 희귀 암에서 중요한 역할을 하며, 이를 억제하거나 분해할 수 있는 화합물은 잠재적으로 효과적인 치료제가 될 수 있.. 2024. 8. 13. 소노가시라 반응(Sonogashira cross coupling) 메카니즘 Sonogashira 교차 결합 반응은 팔라듐 촉매와 구리 촉매를 사용하여 염기의 존재하에 유기 할로겐화물과 말단 알킨의 유기 교차 반응으로 C-C 결합을 생성하는 반응입니다. 팔라듐 촉매화 메커니즘으 시작은 모든 촉매 반응과 마찬가지로 촉매를 사용되는 팔라듐 Pd(0) 이 유기 할로겐 화합물에 산화 산화 첨가되어 팔라듐 Pd(II) 착물을 형성하는 것으로부터 시작됩니다. 함께 첨가된 구리촉매는 말단 알킨과 착물을 형성합니다. 형성된 구리 착물에 의해 말단 양성자의 산도(acidity)를 증가시키고 수소 하나가 쉽게 떨어져나가 구리가 수소 자리에 붙어 아세틸라이드 구조를 만듭니다. 팔라듐 2가(2+) complex와 구리 촉매로부터 형성된 구리 알킨시약이 서로 교차하는 transmetalation 반응이.. 2022. 11. 24. 핵 리액션 (Heck reaction) 메카니즘 Heck 반응은 팔라듐을 촉매로 염기와 함께 사용하여 치환 된 알켄을 만들기 위한 반응으로 유기 할로겐화물과 알켄의 교차 결합 반응입니다. 반응으 시작은 팔라듐이 아릴 할라이드에 산화적 첨가를 하면서 시작되며, 이어서 2가로 바뀐 팔라듐에 올레핀이 배위 결합을 형성하면서 결합이 됩니다. 그런 다음 결합 회전은 시스(cis)와 트랜스(trans)의 입체적 구조가 안정화 되게끔 재 조정 과정이 일어납니다. 서로 치환기들이 걸리적 거리지 않게 되는 과정으로 진행되며, 두 그룹을 서로 트랜스로 배치되고, 이 과정이 마무리되면 β-hydride elimination고정이 일어나 최종 생성물은 트랜스 폼이 됩니다. 팔라듐 촉매의 경우 염기에 의해 reductive elimination과정을 거쳐 2+가에서 영가의 .. 2022. 11. 24. 스즈키 크로스 커플링 반응 (Suzuki reaction) 메카니즘 스즈키 크로스 커플링 반응은 팔라듐 촉매와 염기(B:)를 사용하여 유기 할로겐 화합물과 유기 보렌에 결합된 화합물 간의 C-C 결합을 만들어 내는 반응입니다. 마치 각각의 메탈에 붙어있는 물질을 서로 맞교환하는 반응으로 우리는 이것을 크로스 커플링이라고 부릅니다. 메커니즘은 먼저 영가(Pd0)의 팔라듐이 할겐 화합물 사이로 끼어들어가는 산화 첨가 반응(oxidative addition)이 일어납니다. 이 과정에서 팔라듐은 전자를 2개 잃어버리면서 2가(2+)의 형태를 띠게 됩니다. 그리고 염기성 시약(NaOH, KOH, K2CO3+H2O, Na2 CO3+H2O)에 의해 팔라듐이 공격을 받으면서 할로겐이 떨어져 나오게 됩니다. 그 후에 유기보렌 화합물 역시 염기(B:)에 의해 공격을 받아 보렌염이 형성이 .. 2022. 11. 16. 부크 월드 반응 (Buchwald -Hartwig) 메카니즘 Buchwald -Hartwig 반응은 아민과 탄소의 결합을 만드는데 대단히 유용한 유기화학 반응입니다. 이 반응에는 팔라듐 촉매와 강염기가 사용되는데, 이 시약들은 아릴할라이드와 아민이 cross-coupling을 하는데 기여를 하게 됩니다. (사용되는 강염기는 아민의 종류에 따라 pKa를 확인하여 쉽게 떼어낼 수 있도록 세기 정도를 확인해야 합니다) 반응의 시작은 아릴 할라이드에 팔라듐이 oxidative addition으로 phenyl carbon과 halide사이로 끼어들어가게 됩니다. 이 때 팔라듐은 영가(zero) 에서 phenyl carbon과 halide양쪽으로 붙잡고 있기 때문에 2가(2+)로 변하게 됩니다. 그리고 팔라듐은 아민의 비공유 전자쌍과 배위 결합을 하게 되는데 이런 과정을 l.. 2022. 11. 16. Drug resistance to targeted therapy (2010) 보호되어 있는 글 입니다. 2021. 5. 26. APE1 drug resistance 약물이 될 수 있을까? 보호되어 있는 글 입니다. 2021. 5. 11. 이전 1 2 다음 728x90 반응형
